Tag: biomédical

Le danger des articles de recherche médicale frauduleux

 François LIBMANN
Bases no
436
publié en
2025.05
2490
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littérature scientifique | ist | information scientifique et technique | fake news | biomédical
Le danger des articles de recherche médicale frauduleux Image 1

En 2009 les lignes directrices de la société européenne de cardiologie recommandaient l’usage des bêta bloquants pour protéger le cœur lors d’opération non cardiaque. Ces lignes directrices étaient déduites d’une série d’études menées depuis 1999. Ces directives ont été modifiées en 2013 à la suite d’une « expression of concern » publiée dans L’European Heart Journal recommandant que ces lignes directrices ne dussent plus être appliquées en routine, mais faire l’objet d’une analyse au cas par cas.

En effet, un article publié en 2014 “ Meta-analysis of secure randomised controlled trials of β-blockade to prevent perioperative death in non-cardiac surgery “ de Bouri, S., Shun-Shin, M. J., Cole, G. D., Mayet, J. & Francis, D. P. Heart 100 , 456-464 (2014). a remis drasti­quement en cause les essais réalisés par l’organisme néerlandais DECREASE qui constituaient le socle de ces lignes directrices. Les auteurs ont utilisé pour cela une autre série d’études considérées, elles, comme sûres, réalisées sur un total de 10 529 patients. Les résultats ont montré que l’application des directives de 1999 augmentait la mortalité à 30 jours de 27 %. Les auteurs ont donc recommandé d’abroger sans délai les recommandations de 1999. D’autres auteurs ont considéré que ces mauvaises lignes directrices étaient responsables de jusqu’à 10 000 décès par an au Royaume-Uni.

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Préprints biomédicaux : bioRxiv et medRxiv intègrent openRxiv, une structure de gouvernance indépendante

François LIBMANN
Bases no
435
publié en
2025.04
2606
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science ouverte | open access | littérature scientifique | ist | information scientifique et technique | biomédical | abstracts
Préprints biomédicaux : bioRxiv et medRxiv intègrent ... Image 1

L’écosystème des préprints dans le domaine biomédical connaît une évolution majeure avec la création d’openRxiv, une structure indépendante à but non lucratif destinée à piloter et développer les serveurs de préprints bioRxiv et medRxiv. 

Ces deux plateformes publient les articles scientifiques qui leur sont soumis dès que leurs auteurs les jugent comme terminés, sans attendre une peer review pour décider de la publication dans le journal auquel ils auraient été envoyés. En effet, les délais avant décision peuvent atteindre plusieurs mois et parfois dépasser un an.

● bioRxiv a été créé en 2013 et propose aujourd’hui environ 274 000 documents écrits par 970 000 auteurs, et 4 000 nouveaux documents sont ajoutés chaque mois.

● Pour sa part, medRxiv a été créé en 2019 et propose aujourd’hui près de 66 000 documents écrits par plus de 380 000 auteurs, et 1 000 nou­veaux documents sont ajoutés chaque mois.

Ces deux plateformes ont joué un rôle important pendant la pandémie de COVID 19 au cours de laquelle la diffusion rapide de l’information scien­tifique a été cruciale.

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Une nouvelle forme de peer review se développe rapidement

FRANÇOIS LIBMANN
Bases no
434
publié en
2025.03
4439
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abstracts | archives ouvertes | biomédical | information scientifique et technique | ist | littérature scientifique | open access | références bibliographiques | science ouverte
Une nouvelle forme de peer review se développe rapidement Image 1

Le peer review d’un article académique est, traditionnellement, une revue par les pairs avant publication. Il reste le fondement du fonctionnement de la majorité des éditeurs, qu’ils publient selon le schéma traditionnel dans lequel le lecteur paie en s’abonnant, ou qu’ils publient en open access, schéma dans lequel l’auteur, son institution ou un sponsor règle les frais (Article processing charges, soit APC).

Les limites du peer review traditionnel

Si cette procédure est supposée garantir aux articles publiés un haut niveau de qualité, elle présente l’inconvénient majeur d’imposer un délai parfois long entre le dépôt du manuscrit et la publication effective de l’article.

Cela devient de moins en moins supportable alors même que les développe­ments de la recherche connaissent une accélération significative comme on a pu le constater, en particulier, lors de la pandémie du COVID-19.

S’ajoute la difficulté croissante à trouver des reviewers (en règle générale bénévoles) disponibles, conséquence à la fois de l’inflation du nombre de publications et de la pression que subissent les chercheurs pour publier toujours plus, ce qui leur laisse moins de temps pour se consacrer aux reviews.

Et enfin, rien ne garantit que deux ou trois reviewers (au mieux) auront pu détecter toutes les failles potentielles d’un article. En effet, ces failles pourraient n’apparaître que lorsqu’un nombre plus important de scientifiques aura pu en prendre connaissance.

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AskAdis : une interface intégrant l’IA pour rechercher des synthèses sur les médicaments

François Libmann
Bases no
427
publié en
2024.08
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ist | biomédical | IA
AskAdis : une interface intégrant l’IA pour rechercher des ... Image 1

AskAdis est une interface innovante utilisant l’intelligence artificielle pour fournir des synthèses complètes sur le développement de médicaments. Elle offre des informations validées sur les essais cliniques et les propriétés des médicaments, avec une présentation moderne et intuitive.

Adis est une société spécialisée dans la fourniture de services d’informations et de solutions aux professionnels de la santé et de l’industrie pharmaceutique. Fondée en 1969, Adis fait aujourd’hui partie du groupe Springer Nature.

Elle édite une trentaine de publications spécialisées, offre différents services et propose plusieurs banques de données essentiellement consacrées aux étapes de développement de médicaments.

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Dialog enrichit sa gamme de stratégies clé en main pour le biomédical

François Libmann
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409
publié en
2022.12
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biomédical | méthodologie | information scientifique et technique
Dialog enrichit sa gamme de stratégies clé en main pour le ... Image 1

Dialog Solutions vient d’ajouter trois stratégies prêtes à l’emploi (Hedges) aux sept qu’il proposait déjà dans le domaine biomédical.

La mise à disposition de requêtes préétablies existe depuis un moment déjà tant pour des serveurs/agrégateurs que pour des banques de données, mais font rarement l’objet de l’attention du public des pros de l’info.

Elles peuvent pourtant être appliquées telles quelles ou servir de base à la constitution de nouvelles stratégies de recherche.

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Le MeSH 2017 est maintenant disponible

3297
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Dialog | biomédical | serveur de bases de données | information scientifique et technique
Le MeSH 2017 est maintenant disponible Image 1

Chaque année la National Library of Medecine (NLM) fait évoluer son célèbre thesaurus MeSH (Medical Subject Headings) avec ajout, suppression ou modification des termes.

La version 2017 est maintenant disponible et la banque de données accessible sur plusieurs serveurs va être entièrement rechargée avec cette version. Le rechargement sur Dialog Proquest est annoncé pour le 15 janvier prochain (bases de données MEDLINE et ToxLine).

Auteur : François Libmann, Directeur de publication 

Les outils documentaires du CHU de Rouen : CISMeF, LiSSa et HeTOP

François Libmann
Bases no
378
publié en
2020.02
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Tags
biomédical | serveur de bases de données | information scientifique et technique
Les outils documentaires du CHU de Rouen : CISMeF, LiSSa et ... Image 1

Dès 1995, le CHU de Rouen s’est intéressé aux sites web en langue française concernant la santé puis à la littérature médicale en langue française et a acquis une notoriété certaine. Nous avons choisi dans cet article de nous intéresser aux différents outils documentaires qu’il propose.

CISMef et son moteur DocCISMeF

Cet intérêt du CHU de Rouen a débouché, dans un premier temps, sur le projet de Catalogue et Indexation des Sites Médicaux de langue française (CISMeF) qui a été réalisé par l’équipe qui appartient aujourd’hui au D2IM (Département d’Informatique et d’Information médicale du CHU hôpitaux de Rouen). Ce site s’est développé et se développe toujours de façon continue tant au niveau de son contenu que des possibilités de recherche aujourd’hui très avancées. Il a été distingué par de très nombreux prix, a reçu de nombreux labels et a bénéficié aussi du soutien financier de divers organismes.

Il est d’ailleurs toujours à la recherche de financements pour assurer à la fois la continuité de son développement et la gratuité de son accès qui est un principe de base. Cette recherche permanente de financement est le lot de ce type de produit/service qui a pour principe le libre accès et n’est pas financé par la publicité. Le contenu de CISMeF est centré sur la santé et les sciences médicales, dépassant la médecine proprement dite.
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Pat-INFORMED : une base de données de brevets biomédicaux

Marie-Pierre Vidonne
Bases no
368
publié en
2019.03
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Tags
biomédical | sourcing veille | brevets
Pat-INFORMED : une base de données de brevets biomédicaux Image 1

Marie-Pierre Vidonne du CFIB (Club francophone de l’information brevet) a attiré notre attention sur le lancement récent de la banque de données Pat-INFORMED (Patent Information Initiative for medicines).

Cette banque de données propose des informations sur 14 000 brevets délivrés (uniquement, c’est-à-dire sans références de demandes en cours) issus de 600 familles correspondant à 159 produits différents identifiés par leurs DCI (Dénomination commune internationale, communément appelée « nom générique », ou INN en anglais pour International Nonproprietary Name).

Ces termes sont enregistrés auprès de l’OMS (Organisation Mondiale de la Santé). Il en existe aujourd’hui plus de 8 000.

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L’actualité du monde de l’information - février 2017

Carole Tisserand-Barthole
Bases no
345
publié en
2017.02
1856
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Tags
biomédical | recherche Web | curation | actualités | outils de veille | open data
L’actualité du monde de l’information - février 2017 Image 1

Les nouveautés en matière de contenus

Médecine/Biologie

EBSCO a récemment étendu son partenariat avec Claritive Analytics (qui a repris les activités scientifiques et propriété intellectuelles de Thomson Reuters) afin de proposer BIOSIS Previews et Zoological Record via EBSCOhost. Rappelons que BIOSIS Previews est l’une des plus importantes bases de données bibliographiques en sciences biologiques et que Zoological Record est l’une des plus anciennes bases bibliographiques dédiée à la biologie animale.

Le MeSH 2017 est maintenant disponible. Chaque année la National Library of Medecine (NLM) fait évoluer son célèbre thesaurus MeSH (Medical Subject Headings) avec ajout, suppression ou modification des termes. La banque de données accessible sur plusieurs serveurs va être entièrement rechargée avec cette version (sur Dialog-Proquest notamment).

La base de donnée LiSSa (www.lissa.fr) qui propose plus de 860 000 articles médicaux en français propose une nouvelle version. Parmi les nouveautés, le tri par pertinence, une compatibilité avec tout type d’écran et un nouveau formulaire de recherche avancée.

Quertle, le développeur de la première plateforme de découverte et d’analyse visuelle de données biomédicales basée sur un système d’intelligence artificielle collabore désormais avec Elsevier pour intégrer Science Direct au sein de son outil.

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GreyLit Report : la littérature grise dans le domaine médical

François Libmann
Bases no
326
publié en
2015.05
2016
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Tags
littérature grise | biomédical
GreyLit Report : la littérature grise dans le domaine ... Image 1

Le GreyLit Report offre la publication bimensuelle "Grey literature report in public health".

Cette publication est réalisée par the New York Academy of Medicine et recense la littérature grise dans le domaine médical. On peut s'abonner à cette publication et également chercher dans les archives.

Les références obtenues sont assez détaillées et on dispose d'un lien vers le document.

D'après l'article de Danielle ALOA, bibliothécaire spécialisée à l'Académie de Médecine de New York, publié dans I2D n°1 (Mars 2015), 2 000 personnes sont abonnées à ce service gratuit.

Curieusement on ne trouve pratiquement aucune référence à GreyLit Report dans les banques de données, en tout cas aucune dans celles que nous avons interrogées.

La seule mention que nous ayons trouvée est celle de l'article d'ID2 à l'origine de cet article, dans Cairn.

Mais le présent article sera prochainement référencé dans différentes banques de données. On trouvera donc au moins une mention de GreyLit Report

  • http://www.greylit.org

Les nouveautés de STN, Medline et Chemical Abstracts

François Libmann
Bases no
325
publié en
2015.04
1814
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biomédical | serveur de bases de données | actualités | information scientifique et technique
Les nouveautés de STN, Medline et Chemical Abstracts Image 1

La couverture de la nouvelle plateforme STN s’enrichit

Outre Chemical Abstracts et DWPI, la couverture de bases brevets continue à s’étendre et de nouvelles banques de données ont été chargées dans le domaine biomédical et dans celui des sciences de la vie. Rappelons que cette plateforme, qui est plus puissante que la plateforme classique est uniquement accessible via un contrat forfaitaire annuel.

Medline et ses références d’essais cliniques

Medline a commencé à charger des références d’essais cliniques et continuera à le faire en 2015.

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